Накопительно-ипотечная система (НИС) жилищного обеспечения военнослужащих была разработана в 2004 году и введена в действие федеральным законом от 20 августа 2004 года № 117-ФЗ «О накопительно-ипотечной системе жилищного обеспечения военнослужащих». Работу НИС обеспечивает Федеральное управление накопительно-ипотечной системы жилищного обеспечения военнослужащих (ФГКУ «Росвоенипотека»), созданное в ведении Минобороны России в 2006 году.
Участниками программы являются офицеры, окончившие военные образовательные учреждения или поступившие на военную службу по контракту (начиная с 2005 года), а также прапорщики и мичманы с общей продолжительностью военной службы по контракту не менее трех лет с 2005 года. Помимо этого, стать участниками НИС могут старшины, сержанты, солдаты и матросы, несущие службу во второй раз, но не ранее 2005 года.
Для включения в НИС все военнослужащие, которые имеют право на добровольное вступление в программу, должны написать соответствующий рапорт на имя командира части. После регистрации в служебном журнале рапорт и личные данные военнослужащего направляются и регистрируются в реестре участников накопительно-ипотечной системы. Контроль и ведение базы осуществляют Управление по реализации жилищных программ и Министерство обороны.
Вступившим в НИС участникам присваивается индивидуальный регистрационный 20-значный номер, для которого открывается накопительный счет для начисления выплат. Этот номер остается неизменным в течение всего срока службы, в том числе при смене места службы.
Воспользоваться накопленными средствами военнослужащий может уже спустя три года с начала службы. По программе «Военная ипотека» все накопленные средства на именном счете, а также собственные средства могут быть направлены в качестве первого взноса на квартиру. Дальнейшие обязательные платежи по ипотечному договору будут осуществляться тоже через данный накопительный счет.